EU-hanke selvittää laajaa bakteeriryhmää: Viikissä pureudutaan ruokamyrkytysbakteeriin

Clostridium-suvun bakteereissa piilee sekä suuria uhkia että mittavia mahdollisuuksia. Ne aiheuttavat esimerkiksi sairaalabakteeritartuntoja (C. difficile), tekevät tuhoja elintarvike- ja rehuteollisuudessa (C. perfringens ja C. botulinum) ja saattavat voimistaa bioterrorismmin uhkaa (C. botulinum). Toisaalta ne tarjoavat uusia keinoja syöpähoitoihin tai biopolttoaineiden tuotantoon. Näin mittavien haasteiden edessä tarvitaan bakteerin parempaa molekyylibiologista tuntemusta: alan eurooppalaiset huippututkimusyksiköt ovat yhdistäneet voimansa CLOSTNET-verkostoksi. Suomesta mukana on Helsingin yliopisto.

Suomalaista hanketta vetää professori Miia Lindström eläinlääketieteellisestä tiedekunnasta. Lindströmin projektissa selvitetään Clostridium botulinumin elintarviketurvallisuuden kannalta keskeisten toimintojen geneettistä säätelyä, kuten itiömuodostusta ja itämistä eli germinaatiota. Projektissa tarkastellaan myös bakteerin tuottamaa hermomyrkkyä, botulinumneurotoksiinia, joka on ollut pitkään yksi elintarvike- ja ympäristöhygienian laitoksen tärkeistä tutkimuskohteista.

Tohtorikoulutuspaikkoja yli 20 nuorelle tutkijalle – haku avoinna
Nuorten tutkijoiden puute on määritelty suurimmaksi uhaksi alan eurooppalaisen tutkimuksen kilpailukyvylle. Tämän vuoksi CLOSTNET tarjoaa 22 nuorelle tutkijalle mahdollisuuden tehdä väitöstutkimuksensa Clostridium-bakteerista. Kukin tutkimuskeskus rekrytoi 2 tohtorikoulutettavaa kolmeksi vuodeksi. Vuoden lopussa päättyvä ensimmäinen haku on paraikaa käynnissä, toinen järjestetään keväällä 2010.

Valittavat tohtorikoulutettavat saavat monitieteistä koulutusta, jota he pystyvät soveltamaan sekä elintarvikehygieenisiin ja lääketieteellisiin torjuntakeinoihin patogeenejä vastaan että ei-patogeenien hyödyntämiseen teollisuuden prosesseissa ja tautien estämisessä. Avaintaitoja ovat molekyylimikrobiologian tekniikat, genomiikka sekä kaupallisten sovellusten toteuttaminen. Tarpeista lähtevä, strukturoitu koulutusohjelma muodostuu kursseista, workshopeista ja konferensseista. Lisäksi kaikilla sektoreilla – yliopistossa, alan hallinnossa sekä teollisuudessa – järjestetään käytännön työharjoittelua.

Monikansallinen hanke
Kokonaishanketta johdetaan Nottinghamin yliopistosta, jossa kehitettyä ClosTron-geenimutaatiotekniikkaa hyödynnetään kaikissa verkoston tutkimuksissa. Mukana on tutkimusryhmiä kaikkiaan 7 EU-maasta, Suomen lisäksi mukana ovat Iso-Britannia, Saksa, Ranska, Italia, Slovenia ja Alankomaat. Nelivuotisen projektin budjetti on liki 5 miljoonaa euroa, ja sen rahoittaa EU:n Marie Curie -hanke. Lindströmin ryhmä on saanut hankkeeseen rahoitusta noin 450 000 euroa. 

Lisätietoa
professori Miia Lindström, puh. 09-191 57107, sähköposti: miia.lindstrom(at)helsinki.fi

• Kansainvälinen tutkijakoulutuskurssi valottaa ruokamyrkytysbakteerin molekyyliepidemiologiaa (12.12.2008)
• www.clostridia.net/clostnet-intro.html