Ihmiselle patogeenisten virusten esiintyvyys elintarvikkeissa, vedessä ja muissa ympäristönäytteissä (diagnostiikka, molekyyliepidemiologia ja genetiikka)

Tutkimusryhmän johtaja:
Dosentti Leena Maunula

Ryhmän tutkimuskohteena ovat vesi- ja ruokavälitteiset virukset sekä niiden leviäminen. Erityisesti tulevat kysymykseen suolistossa lisääntyvät enteeriset virukset, jotka aiheuttavat ripulia tai hepatiittia.

Keskeisin tutkimuskohde on norovirus, muita ovat mm. astro-, rota-, adeno, entero- ja sapovirus sekä hepatiitti A- ja E-virus.

Seuraamme virusten kulkureittejä ja esiintyvyyttä elintarvikkeissa ja ympäristössä. Toisaalta tutkitaan myös muutamien virusten kuten hepatiitti E-virusten leviämistä eläinten kautta elintarvikkeisiin.

Tutkimusmenetelmistä keskeisin on geenimonistus, jota käytetään tutkimuksen kaikilla osa-alueilla. Panostamme erityisesti kvantitatiiviseen määritykseen. Muista menetelmistä mainittakoon soluviljely sekä genotyypitys sekvenssianalyysillä ja/tai geelielektroforeesilla.

Tutkijat:
Dosentti Leena Maunula, emeritus professori Carl-Henrik von Bonsdorff, ELL Tuija Kantala, ELL Maija Summa, Maria Rönnqvist ELL, Kemian yo. Kirsi Söderberg

Endeemisen hepatiitti E -viruksen esiintyminen Suomessa

Hankkeessa tutkitaan hepatiitti E-viruksen esiintymistä sekä ihmisissä että eläimissä, erityisesti sioissa. Löydetyt viruskannat genotyypitetään. Potilaista ja eläimistä löydettyjen virusten nukleiinihapposekvenssejä verrataan toisiinsa, sillä mielenkiinnon kohteena on myös virusten mahdollinen siirtyminen eläimestä ihmiseen. Työssä etsitään hepatiitti E-virukselle muita mahdollisia reservoaareja luonnossa mm. piennisäkkäiden joukosta.

Tutkimusta johtaa dosentti Leena Maunula ja vastavana tutkijana toimii ELL Tuija Kantala. Projektin rahoittajana toimivat mm. Euroopan Unioni sekä ABS-tutkijakoulu. Yhteistyökumppaneina toimivat dosentti Maija Lappalainen (HUSLAB virologia), professori Mari Heinonen (Saaren yksikkö), professori Heikki Henttonen (METLA), professori Olli Vapalahti (PELL) sekä FABA jalostus.

Noroviruksen osoitus ja kartoitus elintarvikkeista; leviämisreitit elintarvikkeisiin

Tutkimuksessa keskitytään norovirusanalyysien kehittämiseen elintarvikkeille. Erityisesti kehitetään herkkiä ja luotettavia näytekäsittelymenetelmiä riskielintarvikkeille. Tutkimuskohteena ovat mm. salaatit ja pakastemarjat.

Virusten esiintyvyyttä elintarvikkeissa tullaan kartoittamaan herkimmäksi osoittautuneella menetelmällä. Toisaalta tutkimusten avulla pyritään saamaan myös lisätietoa eläinten merkityksestä norovirusten leviämisessä. Elintarvike-, ympäristö- ja eläinnäytteistä löydetyt kannat analysoidaan mm. nukleiinihapposekvenssejä selvittämällä.

Tutkimusta johtaa dosentti Leena Maunula ja vastavana tutkijana toimii ELL Maija Summa. Projektin rahoittajana toimii Suomen Akatemia. Yhteistyössä on mukana Taina Niskanen (EVIRA).

»» Norovirus koirallisilla peheillä

Virusten detektio ja hallintakeinot prosessiympäristöissä

Uusimpana projektina on vuoden 2009 syksyllä alkanut VIRUSHALLINTA-projekti, jossa rahoittajana on TEKES ja lukuisa määrä asiasta kiinnostuneita yrityksiä. Tutkimuksessa kartoitetaan viruskontaminaatioita aiheuttavia riskitekijöitä elintarviketuotantoketjussa ja vesilaitoksissa. Tutkimukseen kuuluva menetelmäkehitys osaltaan mahdollistaa riskinhallintakeinojen kehittämistä.

Projektia koordinoi VTT ja mukana on myös EVIRA. Helsingin yliopistossa tutkimusta johtaa dosentti Leena Maunula ja vastaavana tutkijana toimii väitöskirjatyötään tekevä eläinlääketieteen opiskelija, ELL Maria Rönnqvist. Väitöskirjassa tutkimuskohteina ovat noroviruksen lisäksi influenssavirukset.

Ruokamyrkytysvirusten monitorointi ja kontrollointi eurooppalaisissa elintarvikeketjuissa

Hankkeessa selvitetään, missä eri vaiheissa ”pellolta pöytään” -elintarvikeketjua riskielintarvikkeet kontaminoituvat viruksilla. Marjat ovat omassa tutkimustyössämme keskeiset seurantakohteet, lisäksi mukana ovat osterit ja vihannekset.

Tutkimuksessa analysoidaan kohdennetusti adeno- ja noroviruksia sekä hepatiitti A ja E -viruksia. Hankkeen tavoitteena on kontaminaatioriskin arviointi sekä tehokkaan HACCP-systeemin kehittäminen viruksille.

Tutkimusta johtaa dosentti Leena Maunula ja tutkimusavustajana toimii kemian yo. Kirsi Söderberg. Projektin rahoittajana toimii Euroopan Unioni. Kotimaassa yhteistyötä tehdään muutamien elintarvikeyritysten kanssa.

Elintarvikkeiden virusanalyysien validointi ja standardointi Pohjoismaissa

Tutkimuksessa kehitetään virusanalyysejä elintarvikkeille ja vesille mm. hakemalla apua uusimmista teknologioista. Tutkimuskohteena ovat noro- ja hepatiitti A-virukset. Projekti jakautuu kahteen osa-alueeseen: virusanalyyseihin vesistä ja elintarvikkeista. Vesitutkimuksessa keskitytään pintavesien analysointiin ja siihen liittyvään menetelmäkehitykseen, mutta myös juomavesi on analysoinnin kohteena.

Projektista vastaa dosentti Leena Maunula ja rahoittajana toimii maa- ja metsätalousministeriö (NKJ-pohjoismainen yhteistyöhanke). Yhteistyössä ovat mukana SMI Tukholmasta, SLV Uppsalasta, NVH Oslosta, MATIS Reykjavikista sekä DTU Kööpenhaminasta.

Mainintoja muista projekteista

EUROROTANET on eurooppalainen verkosto, jossa kerätään tietoja vuosittain esiintyvien rotavirusten genotyypeistä. Seurannan tarkoituksena on selvittää, muuttuuko genotyyppien laatu ja määrä rotavirusrokotusten käyttöönoton myötä. Projektista vastaa dosentti Leena Maunula. Kotimaassa yhteistyötä tehdään dosentti Maija Lappalaisen (HUSLAB virologia, Helsinki), FT Aino Laatikaisen (Islab, Kuopio) sekä dosentti Merja Roivaisen (THL) kanssa.

Kotimaassa yhteistyötä tehdään norovirusseurannan ja -tyypitysten osalta Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen (THL) ja Helsingin ja Uudenmaan sairaanhoitopiirin viruslaboratorion (HUSLAB virologia) kanssa.

Emeritus professori Carl-Henrik von Bonsdorff ja dosentti Leena Maunula toimivat useissa kansainvälisissä asiantuntijatehtävissä (CEN-TAG4-työryhmä: Menetelmät noro- ja hepatiitti A-virusten osoittamiseksi elintarvikkeissa; COST929-hanke: elintarvike- ja ympäristövirologian eurooppalainen asiantuntijaverkosto; WHO CODEX guidelines).